标题：EtiologyofSevereCommunity-AcquiredPneumoniainAdultsBasedonMetagenomicNext-GenerationSequencing:AProspectiveMulticenterStudy（基于mNGS技术的成人重症社区获得性肺炎病因研究：一项多中心的前瞻性研究）
作者：XiaodongWu1*,YuanyuanLi2*,MingZhang3*,XueDong1etal.
单位：
ShanghaiEastHospital,TongjiUniversity,Shanghai,China.
NationalKeyClinicalSpecialty,XiangyaHospital,CentralSouthUniversity，Changsha，China.
TheThirdAffiliatedHospitalofSoochowUniversity,Changzhou,China.
杂志：EBioMedicine.PublishedonlineJan9,.
IF：6.文章简.介
文章摘要成人重症社区获得性肺炎(CAP)病原微生物诊断不明，宏基因组学病原检测技术可以对感染性疾病进行广泛的病原学检测。本项目使用mNGS与常规诊断技术（常规微生物诊断、血清学、PCR）对重症肺炎病人的支气管肺泡灌洗液（BALF）进行检测，并对两种方法的诊断价值进行了比较。
文章简介01样本情况1）患者类型：在年6月至年9月期间，于上海、长沙、杭州、深圳、常州等地的7家医院入组名重症CAP病人。根据美国IDSA/ATS诊断标准，符合1项主要标准或3条以上次要标准即可入组。2）样本类型：肺泡灌洗液3）检测方法：肺泡灌洗液分别进行mNGS的DNA和RNA检测，以及传统微生物学检测（针对细菌、真菌、分支杆菌进行培养及显微镜镜检检测；荧光抗体试剂盒检测流感病*、副流感病*、人呼吸道合胞病*以及腺病*；RT-PCR方法检测肺炎衣原体、肺炎支原体、嗜肺*团菌、流感以及副流感病*），血清学检测使用外周血样本进行。02研究策略主要评估mNGS与传统病原学检测方法相比，在确诊致病性病原方面的诊断价值。03研究结果1）本研究在例重症CAP患者中，（95.4%）例病人找到了致病性病原。其中mNGS明确病原例，占总人数的91.7%；其它诊断方法明确病原80例（36.9%），两种方法具有显著性差异。2）高频检出致病菌为肺炎克雷伯、肺炎链球菌、非典型细菌、腺病*，具有免疫功能的患者高频检出甲型流感病*，而免疫缺陷病人检测耶氏肺孢子菌较多。3）流感病*、人类腺病*、嗜肺*团菌是随季节变化的致病菌。4）mNGS检测结合传统检验方法，发现45.1%的混合感染病人。5）74.2%的重症患者，因mNGS检测方法调整了抗生素治疗。文章结论临床实验证明了使用mNGS检测重症CAP患者的BALF样本，可以显著提高病原诊断率。具有免疫功能的患者和免疫缺陷的重症CAP患者的常见致病病原菌有差异。对于需要病原诊断时效性的重症CAP患者而言，mNGS检测方法可能是开展早期精准抗感染治疗的一个重要诊断工具。文章讨论问题：mNGS对成人重症CAP患者是否具有临床价值？发现：本研究通过多中心的前瞻性临床实验（我国第一个临床实验），7家医院，用时1年的时间入组名患者，证明mNGS检测方法可以显著提高病原诊断率，可能是一个重要诊断工具。点击此处“阅读全文”