和其他呼吸系统疾病一样，我们可以通过优化饲养管理流程和改善畜舍条件、策略性地使用抗生素和免疫接种等措施来有效防控猪支原体肺炎。
优化饲养管理流程和改善畜舍条件优化饲养管理流程和改善畜舍条件是防控猪支原体肺炎的基本要求，通过提高管理水平和改善环境条件，降低猪肺炎支原体的传播和感染以及其他因素或病原体造成的肺脏损伤，可显著提高猪支原体肺炎的防控效果。
全进全出和批次化生产结合的生产方式可能是防控猪支原体肺炎的最重要的措施，猪场根据规模大小、栏舍条件、管理水平实行一周批、三周批或四周批等，同一批次的猪进入同一栋猪舍，所有猪只转出后将栏舍彻底的清洗消*并空栏一段时间后再转入下一批猪，这样的生产方式可以有效阻断病原体从大日龄猪扩散到小日龄猪，各个群体是一个免疫水平均匀的群体，可减少疾病的传播和发生。
早期断奶（3周龄内）可以减少猪肺炎支原体从母猪传播给仔猪。因新母猪的免疫水平较低，其及其后代更容易感染猪肺炎支原体，所以分胎次饲养，如一些大型养殖公司的后备母猪线/一胎母猪生产线，在母猪进入第二胎前，新母猪及其后代都要与多胎次母猪及其后代分开饲养，如此可有效防控包括猪支原体肺炎在内的很多疾病。
此外做好猪场生物安全措施、猪场的引种和隔离驯化、合适的群体大小和饲养密度、改善栏舍的环境（包括温度、空气质量、湿度等）可以有效地防控猪支原体肺炎的发生。
策略性地使用抗生素使用抗生素的前我们需要通过一系列的诊断分析确定猪群的发病与猪肺炎支原体有关（原发/继发），是否有继发其他的疾病如链球菌、副猪、或胸膜肺炎，以确定我们是否需要联合用药，以及做一些必要的流行病学分析，包括可能什么阶段感染的？是否是因为母猪感染后传播给仔猪？如果是，我们则需要同时在母猪上使用抗生素以减少排菌传播给仔猪，以及在仔猪断奶早期使用抗生素。使用抗生素的前提是生产管理和畜舍条件的改善。
四环素类、大环内酯类和双萜烯类（枝原净）是用来控制和治疗猪支原体肺炎的最场用的药物。临床上我们可以进行策略性地使用抗生素对猪支原体肺炎进行预防和控制，在临床症状出现前至少1周开始使用抗生素，并连续使用1-3周时间，可有效减轻临床症状的严重程度以及感染压力。如果猪场感染压力大，停药后疾病的症状可能再一次出现。
免疫接种疫苗免疫是有效防控猪支原体肺炎的最佳手段，在许多国家，猪肺炎支原体疫苗的接种率超过70%（美国超过85%《猪病学》第十版）。疫苗免疫可有效地减少临床症状，减少肺部损伤，降低猪肺炎支原体的感染，提高猪的生产性能，包括提高日增重、降低料肉比和缩短肥猪出栏天数，减少猪场的生产损失，大量研究也证实使用支原体疫苗接种带来的经济效益。因目前还没有发现准确的引起免疫应答的抗原表位，对肺炎支原体的完全保护力需要细胞免疫和体液免疫，所以高效的有佐剂的全细胞苗是最好的。
免疫程序（默沙东安百克）：7-10日龄首免，1ml肌肉注射；
间隔2~4周二免，1ml肌肉注射。
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